食品安全抽樣檢驗是食品安全監督抽檢與風險監測的基礎性工作，是食品藥品監管部門防控食品安全風險、實現科學監管的重要手段。國家食品藥品監督管理總局組建后，認真吸收原質檢、工商、食品藥品監管等部門相關制度建設的有益經驗，制定了《食品安全抽樣檢驗管理辦法》。

在《辦法》制定過程中，國家食品藥品監督管理總局堅持問題導向和制度創新，針對原來多環節多部門食品安全抽樣檢驗工作存在的計劃分散重復、內容交叉、數據缺乏有效利用等問題，確立了“統一制定計劃、統一組織實施、統一數據匯總分析、統一結果利用"的總體思路。在充分調研論證的基礎上，對食品安全抽樣檢驗工作的計劃、抽樣、檢驗、復檢、結果處理、信息發布等進行創新，進一步強化食品生產經營者的主體責任和檢驗機構誠實守信的義務，增強食品安全抽樣檢驗工作的科學性、規范性，提高食品安全監管工作的性和有效性。并且幾個方面進行了改革和創新